WWW.DIS.KONFLIB.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

 
<< HOME
Научная библиотека
CONTACTS

Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |   ...   | 16 |

Генетическая структура нерки, oncorhynchus nerka (walbaum), полуострова камчатка

-- [ Страница 1 ] --

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ УНИТАРНОЕ ПРЕДПРИЯТИЕ

КАМЧАТСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ РЫБНОГО

ХОЗЯЙСТВА И ОКЕАНОГРАФИИ

На правах рукописи

Пильганчук Оксана Александровна

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА НЕРКИ, ONCORHYNCHUS NERKA

(WALBAUM), ПОЛУОСТРОВА КАМЧАТКА

03.02.07 – генетика Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Научный руководитель:

кандидат биологических наук Н.Ю. Шпигальская Петропавловск-Камчатский –

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ………………………………………………………………………….. ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ…………………………………………….…. Ареал, краткая биологическая характеристика и внутривидовая 1.1.

организация нерки…………………………………………………………... Генетическая дифференциация нерки Азии и Северной Америки:

1.2.

состояние изученности данного вопроса………..………………………… 1.2.1. Биохимический полиморфизм……………………..……………..…. 1.2.2. Полиморфизм мтДНК…………………………………….………….. 1.2.3. Изменчивость микросателлитных локусов…………………………. 1.2.4. Однонуклеотидный полиморфизм (SNP)..………………………….

ГЛАВА 2. ХАРАКТЕРИСТИКА МАТЕРИАЛА И МЕТОДОВ

ИССЛЕДОВАНИЯ………………………………………………………………… Материалы...………………………………………………………………... 2.1.

Методы………………………………………………………………………. 2.2.

2.2.1. Молекулярно-генетические методы…….……………….………….. 2.2.2. Методы статистического анализа ……………………….…………..

ГЛАВА 3. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ НЕРКИ ВОСТОЧНОЙ

КАМЧАТКИ…………………………….………………………………………….. Характеристика уровня изменчивости микросателлитов………...……… 3.1.

Пространственная изменчивость аллельных частот………………..…….. 3.2.

Межпопуляционная генетическая дифференциация……..…………….… 3.3.

ГЛАВА 4. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ НЕРКИ ЗАПАДНОЙ

КАМЧАТКИ (на примере бассейна р. Озерная)………...…………………...….. Дифференциация сезонно-экологических форм нерки оз. Курильское 4.1.

(бассейн р. Озерная)……………………………………………………………..… Характеристика дискриминирующей способности микросателлитных 4.2.

локусов нерки бассейна р. Озерная …………...…………………………………. Гетерогенность нерестового хода нерки р. Озерная..…………………….. 4.3.

ГЛАВА 5. ОЦЕНКА ТЕМПОРАЛЬНОЙ СТАБИЛЬНОСТИ

МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ……………………………………………

ГЛАВА 6. ИДЕНТИФИКАЦИЯ МОРСКИХ СМЕШАННЫХ ВЫБОРОК

НЕРКИ НА ОСНОВЕ ИЗМЕНЧИВОСТИ АЛЛЕЛЬНЫХ ЧАСТОТ

МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ…………...……………………………... Оценка разрешающей способности реперных данных………...………... 6.1.

Апробация базы реперных данных.………………………………………. 6.2.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ…………………………………………………………….….….. ВЫВОДЫ………………………………………………………………….……… СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ………………………………………………….……..

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы. Тихоокеанские лососи (род Oncorhynchus) наиболее значимые в промысловом отношении объекты ихтиофауны для многих государств, расположенных на побережье Тихоокеанского бассейна и, главным образом, России. В 30–40-е годы XX в. их уловы достигали 500–600 тыс. тонн (Кляшторин, 2000). Тихоокеанские лососи относятся к анадромным видам рыб, нерестятся один раз в течении жизненного цикла в реках или озерах, молодь мигрирует в Тихий океан, где нагуливается от одного до пяти лет и возвращается обратно к местам нереста. Представителям этого рода свойственна сложная популяционная организация.

Нерка Oncorhynchus nerka Walbaum — на территории России третий по численности вид тихоокеанских лососей (Burgner, 1991; Синяков, 2006).

Наиболее важные и многочисленные стада российской части ареала воспроизводятся на Камчатке, в бассейнах оз. Курильское и р. Камчатка.

Для сохранения и увеличения запасов нерки необходимы детальные и всесторонние исследования популяционных комплексов этого сложно организованного вида, результаты которых позволят разработать рекомендации и создать оптимальные условия для эксплуатации и воспроизводства стад, рационального ведения промысла в прибрежной зоне и нерестовых реках.

Полученная информация поможет понять эволюционные закономерности формирования популяционной структуры и видового ареала.

Для регулирования морского промысла на международном уровне, распределения промысловой нагрузки, описания путей миграций, определения происхождения браконьерских уловов необходимо идентифицировать локальные стада разных регионов в смешанных скоплениях молоди и производителей.

В современных условиях одними из самых эффективных и точных методов идентификации являются молекулярно-генетические. Анализ на основе аллельной изменчивости микросателлитной ДНК наиболее часто и успешно в последние два десятилетия используется в популяционногенетических исследованиях различных видов рыб, в том числе лососевых (Beacham et al., 1998, 1999, 2000, 2006a,b; Афанасьев и др., 2006; Варнавская, 2006; Хрусталева, 2007; Животовский, 2013).

Цель и задачи исследования. Целью настоящей работы является оценка уровня дифференциации нерки Камчатки по микросателлитным локусам и возможности региональной идентификации смешанных уловов по данной системе популяционно-генетических маркеров.



Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

микросателлитных локусов;

2. оценить степень внутри- и межпопуляционной изменчивости нерки Восточной Камчатки;

3. оценить гетерогенность нерки бассейна оз. Курильское;

4. оценить темпоральную стабильность микросателлитных локусов как системы популяционных маркеров;

5. определить разрешающую способность полученной базы реперных данных и провести ее апробацию на примере смешанных выборок молоди и производителей.

Основные положения, выносимые на защиту:

– определен набор наиболее информативных для популяционно-генетических исследований нерки Камчатки микросателлитных локусов;

– выявлена значительная дифференциация нерки восточного побережья Камчатки по частотам аллелей микросателлитных локусов, генетическое сходство популяций соответствует их географической близости, имеет место достоверная связь между географическими расстояниями и величинами популяционно-генетических различий;

– нерка оз. Курильское (бассейн р. Озерная) представлена несколькими сезонно-экологическими формами, генетическая изменчивость которых отражена в гетерогенности особей различных периодов нерестового хода в р. Озерная;

– показано, что микросателлитная ДНК является темпорально стабильным маркером популяционной изменчивости, что позволяет длительное время использовать единожды созданные базы реперных данных при осуществлении идентификационных оценок;

– на основе изменчивости частот аллелей микросателлитных локусов в популяциях нерки Камчатки возможно с достаточно высокой точностью идентифицировать в смешанных выборках популяционные группы восточного побережья и сезонно-экологические формы бассейна оз. Курильское.

Научная новизна. Апробированы тридцать шесть микросателлитных локусов, из них для анализа нерки Камчатки было отобрано девятнадцать, использование которых в исследовании популяций данного региона представляется перспективным. Показана времення устойчивость использованной системы маркеров в течение более чем десятилетнего периода, что позволяет использовать для идентификации смешанных скоплений единожды созданные базы данных.

(микросателлитные последовательности ДНК) исследована нерка рек Навыринваям, Хайлюля, Апука, Пономарка, верхнее течение р. Камчатка и озера Саранное (Командорские о-ва). Показано соответствие степени генетического сходства всех исследованных популяций их географической близости, выявлено наличие достоверной корреляционной связи между географическими расстояниями и величиной генетических различий.

В соответствии с генетической дифференциацией нерки восточного побережья Камчатки, выделены пять региональных групп, уровень различия между которыми превышает уровень межпопуляционной изменчивости.

На основании анализа частот микросателлитных локусов оценена гетерогенность нерестового хода в р. Озерная. Особей, анадромная миграция которых проходит до середины июля, с большой степенью вероятности можно охарактиризовать как раннюю речную форму.

Продемонстрирована возможность идентификации выделенных популяционных групп восточного побережья Камчатки в смешанных уловах молоди нерки в западной части Берингова моря и производителей «ранней» и «поздней» форм нерки в течение нерестового хода в р. Озерная.

Практическая значимость. Аллельные частоты микросателлитных локусов использованы для создания реперной базы данных в целях индивидуальной и популяционной идентификации особей нерки в смешанных скоплениях, а так же генетического мониторинга исследованных популяций и популяционных комплексов. Данные по составу траловых уловов молоди в Беринговом море могут служить основой для количественной оценки особей из выявленных популяционных групп: «оз. Азабачье», «бассейн р. Камчатка», «Карагинский р-н», «север Олюторского р-на» и «Командорские о-ва» и, в дальнейшем, использоваться для прогноза численности производителей в соответствующих районах Восточной Камчатки.

Полученные результаты также могут быть использованы с целью пропорционального распределения промысловой нагрузки на субпопуляции нерки бассейна оз. Курильское, т.е. рациональной эксплуатации данного запаса с учетом популяционной структуры и сохранения природного биоразнообразия.

Апробация результатов. Основные положения и результаты работы были представлены на X Всероссийском популяционном семинаре «Современное состояние и пути развития популяционной биологии» (Ижевск, 17–22 ноября 2008 г.), V съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященном 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина (Москва, 21–28 июня 2009 г.), Всероссийской научной конференции «Водные биологические ресурсы северной части Тихого океана: состояние, мониторинг, управление» (Петропавловск-Камчатский, сентября 2012 г.), Международной рабочей группе Северотихоокеанской комиссии по анадромным видам рыб (NPAFC) «International Workshope on Application of Stock Identification in Defining Marine Distribution and Migration of Salmon»

(Санкт-Петербург, «КамчатНИРО» по итогам научно-исследовательских работ в 2012 г.

(Петропавловск-Камчатский, 2013 г.), а также в виде научных годовых отчетов ФГУП «КамчатНИРО» в 2000–2001 гг. и 2007–2009 гг.

Публикации. По теме диссертации опубликовано 11 научных работ, в числе которых 5 статей в журналах, включенных в «Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертации на соискание ученой степени доктора или кандидата наук».

Личный вклад автора. Автор принимал непосредственное участие на использованием собственных результатов, а так же самостоятельного анализа Н.В. Варнавской (2006). Доля личного участия в экспериментальных исследованиях составила не менее 90%.

Объем и структура диссертации.

Работа изложена на 135 страницах, состоит из введения, обзора литературы (гл. 1), характеристики материалов и методов (гл. 2), результатов и обсуждения (гл. 3–6), заключения, выводов, списка литературы, включающего 220 цитированных источников, из которых 108 на английском языке. Работа иллюстрирована 37-ю рисунками и содержит 25 таблиц.



Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |   ...   | 16 |
 

Похожие материалы:

« Бабин Константин Александрович ОСОБЕННОСТИ ОБМЕНА БИОГЕННЫХ АМИНОВ И СВОБОДНОРАДИКАЛЬНОГО ОКИСЛЕНИЯ ПРИ АЛКОГОЛЬНОМ ДЕЛИРИИ С СОПУТСТВУЮЩИМ ВИРУСНЫМ ГЕПАТИТОМ С 03.01.04 – биохимия Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор В.Э.Цейликман Челябинск - 2014 2 Оглавление Введение Глава 1 Обмен биогенных аминов и состояние свободнорадикального окисления при алкогольном делирии и вирусном гепатите С ...»

« МИНАЙЧЕВА Лариса Ивановна ГЕНЕТИКО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ВРОЖДЕННЫХ ПОРОКОВ РАЗВИТИЯ В СИБИРСКИХ ПОПУЛЯЦИЯХ: МОНИТОРИНГ, МЕДИКО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ КОНСУЛЬТИРОВАНИЕ, ДИСПАНСЕРИЗАЦИЯ 03.02.07 - генетика Диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук Научный консультант: доктор медицинских наук, профессор Л.П.Назаренко Томск - 2014 2 ОГЛАВЛЕНИЕ Стр. Список условных сокращений . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 ВВЕДЕНИЕ . . . ...»

« Гусева Ольга Геннадьевна Напочвенные хищные жесткокрылые и пауки в агроландшафтах Северо-Запада России Шифр и наименование специальности: 03.02.05 – энтомология Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук Санкт-Петербург 2014 2 Содержание Стр. Введение ………………………………….…………………………….4 Глава 1. Обзор литературы Напочвенные хищные жесткокрылые и пауки в различных 1.1. агроландшафтах Значение напочвенных хищных жесткокрылых и пауков как 1.2. энтомофагов Питание ...»

« МЕЙСУРОВА Александра Федоровна БИОМОНИТОРИНГ АТМОСФЕРНОГО ЗАГРЯЗНЕНИЯ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ИК СПЕКТРАЛЬНОГО АНАЛИЗА ИНДИКАТОРНЫХ ВИДОВ ЛИШАЙНИКОВ (НА ПРИМЕРЕ ТВЕРСКОЙ ОБЛАСТИ) Специальность 03.02.08 – экология Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук Научный консультант: доктор химических наук, профессор кафедры физической химии ФГБОУ ВПО Тверской государственный университет Пахомов Павел Михайлович Тверь-2014 1 ОГЛАВЛЕНИЕ ВВЕДЕНИЕ Глава 1. ОСНОВНЫЕ ...»

« Русецкая Наталья Юрьевна СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ БИОЛОГИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ ХАЛЬКОГЕНОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ 03.01.04 – биохимия Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук Научный консультант: доктор медицинских наук, профессор В.Б. Бородулин Саратов 2014 2 ОГЛАВЛЕНИЕ Список используемых сокращений……………………………………………….5 Введение……………………….…………………………………………………….7 Глава 1. Обзор литературы….……………………………….…….…………14 Халькогены. Физико-химические ...»

«Орлов Алексей Владимирович РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ИММУНОАНАЛИЗА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МАГНИТНЫХ НАНОМАРКЕРОВ Специальность 03.01.02 – Биофизика, 03.01.08 – Биоинженерия ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Научный руководитель: кандидат физико-математических наук Никитин П.И. Москва 2014 2 Оглавление Введение Глава 1. Обзор литературы 1.1. Антитела в иммуноанализе 1.2. Типы и форматы иммуноанализа 1.3. Основные количественные характеристики иммуноанализа . 25 1.4. ...»

« Винарский Максим Викторович ЛЕГОЧНЫЕ МОЛЛЮСКИ (MOLLUSCA: GASTROPODA: LYMNAEIFORMES) ВОДОЕМОВ УРАЛА И ЗАПАДНОЙ СИБИРИ специальность 03.02.04 – зоология диссертация на соискание ученой степени доктор биологических наук научный консультант д.б.н., профессор С.И. Андреева Омск 2014 ОГЛАВЛЕНИЕ ВВЕДЕНИЕ………………………………………………………………………. 5 Глава 1. ХАРАКТЕРИСТИКА УРАЛО-ЗАПАДНО-СИБИРСКОГО РЕГИОНА И ИСТОРИЯ ИЗУЧЕНИЯ ЕГО МАЛАКОФАУНЫ………………. 11 1.1. История изучения малакофауны водоемов Урала ...»

« Ильичева Екатерина Юрьевна МЕХАНИЗМЫ ВЛИЯНИЯ ИОНОВ СЕРЕБРА НА МЕТАБОЛИЗМ МЕДИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ 03.01.04 – биохимия Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор Н. В. Цымбаленко Санкт-Петербург, 2014 2 ОГЛАВЛЕНИЕ ВВЕДЕНИЕ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1. 1.1. Биологическая роль меди 1.2. Белки, участвующие в транспорте меди 1.3. Два типа метаболизма меди в организме млекопитающих 1.4. Животные модели, ...»

« Дулепова Наталья Алексеевна ФЛОРА И РАСТИТЕЛЬНОСТЬ РАЗВЕВАЕМЫХ ПЕСКОВ ЗАБАЙКАЛЬЯ 03.02.01 – Ботаника Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук Научный руководитель д.б.н., c.н.с., А.Ю. Королюк Новосибирск – 2014 2 ОГЛАВЛЕНИЕ ВВЕДЕНИЕ ГЛАВА 1. Материалы и методы исследования 1.1. Район и объект исследования 1.2. Методы анализа флор 1.3. Методы классификации и пространственной структуры растительности. 12 ГЛАВА 2. Физико-географическое описание и ...»

« ДЖАМБЕТОВА ПЕТИМАТ МАХМУДОВНА ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДСТВИЯ ЗАГРЯЗНЕНИЯ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НЕФТЕПРОДУКТАМИ В ЧЕЧЕНСКОЙ РЕСПУБЛИКЕ 03.02.07 – генетика Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук Научные консультанты: доктор биологических наук, профессор Сычева Л.П.; доктор биологических наук Рубанович А.В. Грозный – 2014   2 СОДЕРЖАНИЕ Список сокращений 6 Общая характеристика работы 7 ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 16 1.1. Влияние загрязнений окружающей среды ...»




 
© 2013 www.dis.konflib.ru - «Бесплатная электронная библиотека»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.